Frequency of frontotemporal dementia-related gene variants in Turkey

Abstract

Frontotemporal demansın (FTD) klinik heterojenliği gibi genetik temeli de çeşitlidir ve hastalık patogenezinde çok sayıda moleküler yolakların rol oynadığı düşünülmektedir. Bu çalışmada FTD ile ilişkili genler, 175 indeks FTD hastasından oluşan bir Türk kohortunda GRN, MAPT, TARDBP, FUS, CHMP2B ve VCP genlerini içeren bir gen paneli ile değerlendirildi. 16 hastada (%9,1) potansiyel genetik ilişkiler araştırıldı; beş varyant (GRN'de p.(Gly35Glufs) ve p.(Cys253Ter); VCP'de p.(Arg95Cys); TARDBP'de p.(Met405Val) ve MAPT'de p.(Pro636Leu)) patojenik (P) veya olası olarak sınıflandırıldı dört ailesel ve bir sporadik hastada patojenik (LP). Ailesel vakalarda MAPT, CHMP2B ve FUS'ta üç yeni varyant da tanımlandı. En sık görülen patojenik varyantlar %1,14 (2/175) sıklıkla GRN geninde gözlendi ve bu oran, önemi belirsiz varyantlar (VUS) dahil olmak üzere %4,57 (8/175) oldu. Türk FTD hastalarının en geniş kohortunun yer aldığı bu çalışmada, GRN ve MAPT varyantları en sık görülen genetik birliktelikler olarak belirlendi; klinik bulguları uyumlu olan hastalarda VCP, TARDBP, CHMP2B ve FUS varyantları gibi nadir nedenlerin de göz önünde bulundurulması önerilmektedir. (C) 2021 Elsevier Inc. Tüm hakları saklıdır.

Just as its clinical heterogeneity, genetic basis of Frontotemporal dementia (FTD) is also diverse and multiple molecular pathways are thought to be involved in disease pathogenesis. In the present study, FTD-related genes were evaluated in a Turkish cohort of 175 index FTD patients with a gene panel including GRN, MAPT, TARDBP, FUS, CHMP2B and VCP genes. Potential genetic associations were prospected in 16 patients (9.1%); five variants (p.(Gly35Glufs) and p.(Cys253Ter) in GRN; p.(Arg95Cys) in VCP; p.(Met405Val) in TARDBP and p.(Pro636Leu) in MAPT) were classified as pathogenic (P) or likely pathogenic (LP), in four familial and one sporadic patients. Three novel variants in MAPT, CHMP2B and FUS were also identified in familial cases. The most common pathogenic variants were observed in the GRN gene with a frequency of 1.14% (2/175) and this rate was 4.57% (8/175), including variants of uncertain significance (VUS). In this study with the largest cohort of Turkish FTD patients, GRN and MAPT variants were identified as the most common genetic associations; and rare causes like VCP, TARDBP, CHMP2B and FUS variants are recommended to be considered in patients with compatible clinical findings. (C) 2021 Elsevier Inc. All rights reserved.